В минувшую пятницу собрались с самыми стойкими, кто не побоялся осеннего дождя, и разобрались с основами поиска мутаций в геноме. Помимо анализа через командную строку, рассмотрели как сделать это в…
Read MoreОдним из популярных методов современной биоинформатики является секвенирование РНК - транскриптома клетки, позволяющего оценить экспрессию генов и оценить функционирование клетки в норме и при патологии. Разберёмся со всем этим в…
Read MoreВ эту среду прошло уже десятое заседание в этом году! Изучили теорию по сборке генома, а также критерии оценки сборки. На практике поработали с SPAdes. Благодарим всех присутствующих за уделённое…
Read MoreВ прошлую среду состоялось заседание с приглашённым спикером - Дмитрием Дмитриевичем Пензаром, ФББ МГУ, AIRI. В ходе его доклада узнали о применении искусственного интеллекта к медицинским задачам, обсудили недостатки и…
Read MoreРАБОТА С БАЗОЙ ДАННЫХ IEDBЧто будет на заседании:Разберёмся с понятием реляционной базы данныхРассмотрим СУБД на примере MySQL Изучим устройство IEDB (Immune Epitope Database)Пироговский Университет – флагман медицинского образования в РоссииПироговский…
Read MoreЧто было на заседании:️ Разобрали методы получения последовательностей сайтов связывания транскрипционных факторов и генетических вариантов;️ Познакомились с новым подходом, позволяющим предсказывать патогенность вариантов в сайтах связывания транскрипционных факторов;️ Реализовали пайплайн…
Read More️ Обсудили подход к анализу комбинированного пространства белок-лигнад️ Как построить такую модель и не совершить ложного открытия️ Преимущества и перспективы глобальных прогностических моделей Лектор, Карасев Дмитрий Алексеевич, к.б.н., н.с. Лаборатории…
Read MoreЛимитирующие факторы использования больших языковых моделей (LLM) в биомедицине включают их склонность к галлюцинациям и высокие требования к вычислительным ресурсам. Решением может стать технология Retrieval Augmented Generation (RAG), которая сочетает…
Read MoreМАСТЕР-КЛАСС ПО NEXTFLOWNextflow — это мощный инструмент для создания воспроизводимых и масштабируемых вычислительных пайплайнов, который становится стандартом в биоинформатике и data science. На мастер-классе познакомились с его основными возможностями, научились…
Read MoreГенная инженерия — это ключевой инструмент современной биотехнологии, объединяющий молекулярную биологию и биоинформатику для создания генетических конструкций с заданными свойствами. На заседании мы разберем полный цикл работы, начиная с дизайна…
Read More