Состоялось очередное заседания кружка биоинформатики. Нашими гостями стали преподаватели кафедры биоинформатики, которые поделились существующими проектами и научными исследованиями, в которых можно принять участие и подробно рассказали о них и можно…
Read MoreНа втором заседании кружка преподаватели кафедры биоинформатики, поделились существующими проектами и научными исследованиями, в которых можно принять участие Преподаватели подробно рассказали о них, можно ыло позадавать им вопросы. Геноцентричная оценка…
Read MoreДорогие друзья, рады сообщить, что Главный военный клинический госпиталь им. Н.Н. Бурденко организовывает Студенческий кружок «Учусь у Бурденко» и открывает свои двери всем желающим! Особенно актуально для будущих ординаторов. Пироговский…
Read MoreСНК кафедры биоинформатики Пироговского Университета принял участие в II Международной конференции «Геномика, метагеномика и молекулярная биология микроорганизмов»Пироговский Университет – флагман медицинского образования в РоссииПироговский Университет – это один из самых…
Read MoreВведение в Биоинформатику: Python и Linux.Заседание было ориентировано на аудиторию без опыта программирования, так что в части про Python разобрались с основой синтаксиса языка и попробовали написать свою первую программу…
Read MoreЧто было на заседании:История и применимость глубокого обучения, математический аппарат и ключевые понятия;Построение и обучение модели глубокого обучения: функции ошибки, оптимизаторы и обратное распространение ошибки;Практическая реализация перцептрона на чистом Python…
Read MoreНа заседании мы: ознакомились с методом глубокого обучения; изучили архитектуру перцептрона; написали бинарный нейросетевой классификатор на чистом python.Благодарим всех присутствующих за уделённое время и ждём на следующих заседаниях нашего СНК…
Read MoreПосле ряда заседаний по тематике искусственного интеллекта и программирования перешли к рассмотрению биоинформатических методов В пятницу, на четвёртом заседании СНК, познакомились с одним из основных методов анализа ДНК - выравниванием.Что…
Read MoreНа заседании мы: разобрались с видами и задачами выравнивания; изучили алгоритмы Смита-Ватермана и Нидлмана-Вунша; на практике сделали выравнивание реальных данных из базы NCBI SRA с помощью bwa и открыли результаты…
Read MoreПродолжили тему, рассмотренную на прошлом заседании. После выравнивания прочтений на референс идёт этап поиска нуклеотидных замен и инделов - variant calling.Что было на заседании: Разберём пайплайн для поиска однонуклеотидных полиморфизмов;…
Read More